Я бы в первую очередь посмотрел карбюраторы на предмет рывков. Если как ты говоришь сцепление "хватает" в самом конце, то при его умирании наблюдался бы заброс оборотов при резком старте или откручивании, будто кто тебе сцепление поджимает. Так что все вопросы сначала к жиклерам, мембранам и иглам
Еще на каких оборотах, если ниже 2х тысяч, то это вполне нормально для твина. Разряжение там скачет будь здоров
На пятой это может не чувствоваться, по той причине, что мотор легче проворачивается за счет качения мотоцикла.
Стук скорее всего от мертвых демпферов, сцепление стука именно при отпускании не должно производить. А то, что в самом конце "хватает", не айс. Отпусти трос сцепления, чтобы был у ручки небольшой свободный ход, и посмотри, если все равно в конце сцепляется - диски / пружинки просятся в помойное ведро.
Шелест - скорее всего от цепи, когда ты разгоняешься - мотор тянет, натянута верхняя ветка цепи, а когда тормозишь двигателем, то нижняя. Болтающейся как сопля в полете верхней ветке есть обо что пошелестеть. Изменение звука цепи при переходе от торможения двигателем к разгону очень хорошо слышно в тоннелях, когда около стенки едешь. Соответственно проверить, как натянута цепь, как поживают её направляющие, и вообще в каком веке она мазалась.
З.Ы. Подвязывай с экзистом, все на wemoto, сроки те же, только дешевле раза в 2 выйдет